Наука, що лежить в основі систем FCU, використовує фундаментальні принципи фізики, особливо закони термодинаміки, які керують процесами, пов’язаними з теплопередачею, як-от провідність і конвекція. Поглинання тепла відбувається через змійовик, коли холодоагент випаровується для охолодження в режимі охолодження.
Що стосується практичного значення, система FCU має рух повітря та холодоагенту. У режимі охолодження він забирає тепліше повітря з цього простору та обдуває його теплообмінником. Таким чином, холодоагент відбирає тепло від повітря, таким чином охолоджуючи його.
Це прохолодне повітря потім повторно циркулює в кімнаті, ефективно її охолоджуючи. Однак у режимі опалення використовується зворотний процес. Тепло відводиться від холодоагенту через змійовик і передається повітрю, нагріваючи його перед тим, як випустити назад у кімнату.